Protein–RNA interactions for Protein: P28072

PSMB6, Proteasome subunit beta type-6, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB6P28072 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSMB6P28072 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSMB6P28072 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSMB6P28072 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSMB6P28072 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSMB6P28072 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSMB6P28072 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSMB6P28072 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSMB6P28072 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSMB6P28072 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSMB6P28072 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSMB6P28072 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSMB6P28072 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSMB6P28072 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSMB6P28072 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSMB6P28072 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSMB6P28072 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSMB6P28072 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
PSMB6P28072 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSMB6P28072 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSMB6P28072 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSMB6P28072 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSMB6P28072 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSMB6P28072 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSMB6P28072 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSMB6P28072 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSMB6P28072 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSMB6P28072 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB6P28072 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB6P28072 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB6P28072 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB6P28072 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB6P28072 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB6P28072 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB6P28072 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB6P28072 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB6P28072 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB6P28072 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB6P28072 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMB6P28072 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMB6P28072 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMB6P28072 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMB6P28072 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMB6P28072 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMB6P28072 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMB6P28072 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMB6P28072 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMB6P28072 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMB6P28072 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMB6P28072 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB6P28072 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB6P28072 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB6P28072 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB6P28072 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB6P28072 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB6P28072 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB6P28072 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB6P28072 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB6P28072 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB6P28072 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB6P28072 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB6P28072 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB6P28072 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB6P28072 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB6P28072 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB6P28072 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB6P28072 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB6P28072 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB6P28072 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB6P28072 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB6P28072 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB6P28072 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB6P28072 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB6P28072 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB6P28072 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB6P28072 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB6P28072 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB6P28072 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB6P28072 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB6P28072 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB6P28072 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB6P28072 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB6P28072 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB6P28072 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB6P28072 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB6P28072 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB6P28072 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB6P28072 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB6P28072 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PSMB6P28072 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB6P28072 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB6P28072 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB6P28072 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB6P28072 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB6P28072 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB6P28072 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB6P28072 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB6P28072 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB6P28072 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB6P28072 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms