Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMA4P25789 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMA4P25789 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PSMA4P25789 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMA4P25789 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMA4P25789 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMA4P25789 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMA4P25789 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMA4P25789 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMA4P25789 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMA4P25789 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMA4P25789 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMA4P25789 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMA4P25789 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMA4P25789 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMA4P25789 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMA4P25789 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMA4P25789 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMA4P25789 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMA4P25789 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMA4P25789 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMA4P25789 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMA4P25789 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMA4P25789 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMA4P25789 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMA4P25789 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMA4P25789 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMA4P25789 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMA4P25789 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMA4P25789 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMA4P25789 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMA4P25789 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMA4P25789 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMA4P25789 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMA4P25789 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMA4P25789 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMA4P25789 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMA4P25789 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMA4P25789 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMA4P25789 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMA4P25789 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMA4P25789 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMA4P25789 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMA4P25789 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMA4P25789 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMA4P25789 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMA4P25789 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMA4P25789 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMA4P25789 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMA4P25789 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMA4P25789 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMA4P25789 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMA4P25789 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMA4P25789 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMA4P25789 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMA4P25789 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMA4P25789 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMA4P25789 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMA4P25789 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMA4P25789 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMA4P25789 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMA4P25789 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMA4P25789 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMA4P25789 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMA4P25789 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMA4P25789 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMA4P25789 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMA4P25789 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMA4P25789 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMA4P25789 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMA4P25789 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMA4P25789 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMA4P25789 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMA4P25789 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMA4P25789 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMA4P25789 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMA4P25789 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMA4P25789 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMA4P25789 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMA4P25789 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMA4P25789 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMA4P25789 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMA4P25789 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMA4P25789 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMA4P25789 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMA4P25789 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMA4P25789 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMA4P25789 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMA4P25789 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMA4P25789 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMA4P25789 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMA4P25789 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMA4P25789 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMA4P25789 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMA4P25789 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMA4P25789 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMA4P25789 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMA4P25789 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMA4P25789 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMA4P25789 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms