Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRZ1P23471 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRZ1P23471 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRZ1P23471 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRZ1P23471 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRZ1P23471 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRZ1P23471 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRZ1P23471 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRZ1P23471 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRZ1P23471 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRZ1P23471 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRZ1P23471 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRZ1P23471 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRZ1P23471 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRZ1P23471 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRZ1P23471 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRZ1P23471 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRZ1P23471 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRZ1P23471 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRZ1P23471 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRZ1P23471 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRZ1P23471 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRZ1P23471 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRZ1P23471 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRZ1P23471 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRZ1P23471 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRZ1P23471 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRZ1P23471 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRZ1P23471 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRZ1P23471 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRZ1P23471 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRZ1P23471 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRZ1P23471 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPRZ1P23471 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPRZ1P23471 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRZ1P23471 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRZ1P23471 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRZ1P23471 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRZ1P23471 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRZ1P23471 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRZ1P23471 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRZ1P23471 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRZ1P23471 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRZ1P23471 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRZ1P23471 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRZ1P23471 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRZ1P23471 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRZ1P23471 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRZ1P23471 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRZ1P23471 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRZ1P23471 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRZ1P23471 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRZ1P23471 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRZ1P23471 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRZ1P23471 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRZ1P23471 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRZ1P23471 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRZ1P23471 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRZ1P23471 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRZ1P23471 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRZ1P23471 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRZ1P23471 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRZ1P23471 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRZ1P23471 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRZ1P23471 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRZ1P23471 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRZ1P23471 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRZ1P23471 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRZ1P23471 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRZ1P23471 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRZ1P23471 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRZ1P23471 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRZ1P23471 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRZ1P23471 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRZ1P23471 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRZ1P23471 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRZ1P23471 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRZ1P23471 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRZ1P23471 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRZ1P23471 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRZ1P23471 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRZ1P23471 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRZ1P23471 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRZ1P23471 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRZ1P23471 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRZ1P23471 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRZ1P23471 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRZ1P23471 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRZ1P23471 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRZ1P23471 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRZ1P23471 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRZ1P23471 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRZ1P23471 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRZ1P23471 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRZ1P23471 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRZ1P23471 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRZ1P23471 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRZ1P23471 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRZ1P23471 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRZ1P23471 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms