Protein–RNA interactions for Protein: P20138

CD33, Myeloid cell surface antigen CD33, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD33P20138 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD33P20138 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD33P20138 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD33P20138 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD33P20138 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD33P20138 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD33P20138 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD33P20138 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD33P20138 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD33P20138 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD33P20138 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD33P20138 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD33P20138 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD33P20138 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD33P20138 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD33P20138 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD33P20138 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD33P20138 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD33P20138 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD33P20138 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD33P20138 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD33P20138 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD33P20138 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD33P20138 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD33P20138 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD33P20138 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD33P20138 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD33P20138 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD33P20138 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD33P20138 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD33P20138 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD33P20138 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD33P20138 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD33P20138 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD33P20138 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD33P20138 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD33P20138 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD33P20138 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD33P20138 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CD33P20138 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD33P20138 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CD33P20138 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CD33P20138 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CD33P20138 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CD33P20138 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CD33P20138 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CD33P20138 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD33P20138 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD33P20138 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD33P20138 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD33P20138 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD33P20138 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD33P20138 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD33P20138 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD33P20138 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CD33P20138 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD33P20138 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD33P20138 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD33P20138 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD33P20138 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD33P20138 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD33P20138 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD33P20138 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD33P20138 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD33P20138 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD33P20138 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD33P20138 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD33P20138 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD33P20138 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD33P20138 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD33P20138 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD33P20138 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CD33P20138 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD33P20138 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD33P20138 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD33P20138 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD33P20138 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD33P20138 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD33P20138 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD33P20138 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CD33P20138 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD33P20138 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD33P20138 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD33P20138 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD33P20138 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD33P20138 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD33P20138 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD33P20138 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD33P20138 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD33P20138 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD33P20138 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD33P20138 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD33P20138 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD33P20138 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD33P20138 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD33P20138 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD33P20138 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD33P20138 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD33P20138 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD33P20138 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms