Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VCLP18206 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VCLP18206 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VCLP18206 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VCLP18206 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VCLP18206 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VCLP18206 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VCLP18206 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VCLP18206 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VCLP18206 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VCLP18206 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VCLP18206 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VCLP18206 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VCLP18206 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VCLP18206 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VCLP18206 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VCLP18206 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VCLP18206 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VCLP18206 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VCLP18206 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
VCLP18206 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VCLP18206 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
VCLP18206 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VCLP18206 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
VCLP18206 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VCLP18206 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VCLP18206 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
VCLP18206 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VCLP18206 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VCLP18206 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VCLP18206 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VCLP18206 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VCLP18206 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VCLP18206 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VCLP18206 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VCLP18206 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VCLP18206 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VCLP18206 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VCLP18206 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VCLP18206 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VCLP18206 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VCLP18206 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
VCLP18206 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VCLP18206 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VCLP18206 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VCLP18206 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VCLP18206 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VCLP18206 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VCLP18206 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VCLP18206 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VCLP18206 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VCLP18206 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VCLP18206 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VCLP18206 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VCLP18206 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VCLP18206 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VCLP18206 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VCLP18206 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VCLP18206 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VCLP18206 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VCLP18206 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VCLP18206 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VCLP18206 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VCLP18206 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VCLP18206 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VCLP18206 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
VCLP18206 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VCLP18206 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VCLP18206 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VCLP18206 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VCLP18206 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VCLP18206 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VCLP18206 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
VCLP18206 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VCLP18206 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VCLP18206 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VCLP18206 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VCLP18206 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VCLP18206 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
VCLP18206 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VCLP18206 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VCLP18206 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
VCLP18206 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VCLP18206 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VCLP18206 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VCLP18206 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VCLP18206 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VCLP18206 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VCLP18206 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VCLP18206 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VCLP18206 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VCLP18206 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VCLP18206 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
VCLP18206 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VCLP18206 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VCLP18206 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VCLP18206 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VCLP18206 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VCLP18206 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
VCLP18206 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms