Protein–RNA interactions for Protein: P17707

AMD1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMD1P17707 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AMD1P17707 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AMD1P17707 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AMD1P17707 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AMD1P17707 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AMD1P17707 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
AMD1P17707 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AMD1P17707 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AMD1P17707 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AMD1P17707 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
AMD1P17707 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AMD1P17707 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AMD1P17707 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AMD1P17707 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
AMD1P17707 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
AMD1P17707 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AMD1P17707 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AMD1P17707 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AMD1P17707 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AMD1P17707 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AMD1P17707 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AMD1P17707 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AMD1P17707 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AMD1P17707 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AMD1P17707 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AMD1P17707 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AMD1P17707 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AMD1P17707 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AMD1P17707 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AMD1P17707 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AMD1P17707 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
AMD1P17707 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AMD1P17707 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AMD1P17707 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AMD1P17707 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AMD1P17707 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AMD1P17707 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AMD1P17707 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AMD1P17707 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AMD1P17707 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AMD1P17707 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AMD1P17707 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AMD1P17707 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AMD1P17707 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AMD1P17707 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AMD1P17707 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AMD1P17707 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AMD1P17707 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AMD1P17707 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AMD1P17707 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AMD1P17707 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AMD1P17707 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AMD1P17707 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AMD1P17707 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AMD1P17707 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AMD1P17707 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AMD1P17707 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AMD1P17707 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AMD1P17707 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AMD1P17707 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AMD1P17707 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AMD1P17707 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AMD1P17707 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AMD1P17707 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AMD1P17707 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AMD1P17707 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AMD1P17707 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AMD1P17707 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
AMD1P17707 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AMD1P17707 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AMD1P17707 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AMD1P17707 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AMD1P17707 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AMD1P17707 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AMD1P17707 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AMD1P17707 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
AMD1P17707 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AMD1P17707 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AMD1P17707 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AMD1P17707 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AMD1P17707 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AMD1P17707 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
AMD1P17707 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
AMD1P17707 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
AMD1P17707 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
AMD1P17707 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
AMD1P17707 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
AMD1P17707 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AMD1P17707 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AMD1P17707 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AMD1P17707 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AMD1P17707 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AMD1P17707 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AMD1P17707 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AMD1P17707 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AMD1P17707 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AMD1P17707 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AMD1P17707 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AMD1P17707 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AMD1P17707 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms