Protein–RNA interactions for Protein: P17301

ITGA2, Integrin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2P17301 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA2P17301 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA2P17301 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA2P17301 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA2P17301 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA2P17301 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA2P17301 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA2P17301 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA2P17301 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA2P17301 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA2P17301 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA2P17301 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA2P17301 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA2P17301 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA2P17301 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA2P17301 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA2P17301 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA2P17301 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA2P17301 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA2P17301 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA2P17301 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA2P17301 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA2P17301 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA2P17301 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA2P17301 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA2P17301 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA2P17301 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ITGA2P17301 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ITGA2P17301 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
ITGA2P17301 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA2P17301 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA2P17301 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA2P17301 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA2P17301 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA2P17301 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA2P17301 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA2P17301 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA2P17301 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA2P17301 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA2P17301 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA2P17301 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA2P17301 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA2P17301 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA2P17301 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA2P17301 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA2P17301 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA2P17301 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA2P17301 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA2P17301 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA2P17301 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA2P17301 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA2P17301 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA2P17301 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA2P17301 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA2P17301 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA2P17301 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA2P17301 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA2P17301 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA2P17301 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA2P17301 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA2P17301 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA2P17301 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA2P17301 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA2P17301 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA2P17301 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA2P17301 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA2P17301 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA2P17301 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA2P17301 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA2P17301 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA2P17301 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA2P17301 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA2P17301 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA2P17301 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA2P17301 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA2P17301 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA2P17301 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA2P17301 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA2P17301 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA2P17301 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA2P17301 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA2P17301 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA2P17301 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA2P17301 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA2P17301 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA2P17301 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA2P17301 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA2P17301 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA2P17301 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA2P17301 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA2P17301 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
ITGA2P17301 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ITGA2P17301 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ITGA2P17301 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ITGA2P17301 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA2P17301 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA2P17301 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA2P17301 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA2P17301 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA2P17301 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms