Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP2A2P16615 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP2A2P16615 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP2A2P16615 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP2A2P16615 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP2A2P16615 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP2A2P16615 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP2A2P16615 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP2A2P16615 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP2A2P16615 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP2A2P16615 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP2A2P16615 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP2A2P16615 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP2A2P16615 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP2A2P16615 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP2A2P16615 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP2A2P16615 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP2A2P16615 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP2A2P16615 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP2A2P16615 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP2A2P16615 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ATP2A2P16615 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ATP2A2P16615 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP2A2P16615 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP2A2P16615 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP2A2P16615 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP2A2P16615 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP2A2P16615 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP2A2P16615 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP2A2P16615 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP2A2P16615 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP2A2P16615 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP2A2P16615 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP2A2P16615 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP2A2P16615 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP2A2P16615 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP2A2P16615 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP2A2P16615 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP2A2P16615 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP2A2P16615 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP2A2P16615 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP2A2P16615 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP2A2P16615 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP2A2P16615 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP2A2P16615 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP2A2P16615 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP2A2P16615 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP2A2P16615 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP2A2P16615 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP2A2P16615 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP2A2P16615 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP2A2P16615 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP2A2P16615 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP2A2P16615 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP2A2P16615 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP2A2P16615 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP2A2P16615 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP2A2P16615 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP2A2P16615 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP2A2P16615 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP2A2P16615 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP2A2P16615 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP2A2P16615 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP2A2P16615 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP2A2P16615 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP2A2P16615 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP2A2P16615 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP2A2P16615 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP2A2P16615 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP2A2P16615 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP2A2P16615 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP2A2P16615 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP2A2P16615 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP2A2P16615 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP2A2P16615 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP2A2P16615 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP2A2P16615 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP2A2P16615 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP2A2P16615 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP2A2P16615 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP2A2P16615 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP2A2P16615 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP2A2P16615 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP2A2P16615 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP2A2P16615 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP2A2P16615 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP2A2P16615 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP2A2P16615 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP2A2P16615 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP2A2P16615 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP2A2P16615 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP2A2P16615 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP2A2P16615 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP2A2P16615 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP2A2P16615 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP2A2P16615 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP2A2P16615 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP2A2P16615 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP2A2P16615 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP2A2P16615 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms