Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CD8BP10966 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CD8BP10966 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CD8BP10966 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CD8BP10966 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CD8BP10966 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CD8BP10966 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CD8BP10966 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
CD8BP10966 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
CD8BP10966 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD8BP10966 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD8BP10966 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD8BP10966 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD8BP10966 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD8BP10966 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD8BP10966 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD8BP10966 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD8BP10966 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD8BP10966 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD8BP10966 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD8BP10966 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD8BP10966 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CD8BP10966 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CD8BP10966 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CD8BP10966 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CD8BP10966 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CD8BP10966 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CD8BP10966 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CD8BP10966 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CD8BP10966 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CD8BP10966 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CD8BP10966 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CD8BP10966 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CD8BP10966 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CD8BP10966 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD8BP10966 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD8BP10966 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD8BP10966 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD8BP10966 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CD8BP10966 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD8BP10966 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD8BP10966 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD8BP10966 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD8BP10966 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD8BP10966 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD8BP10966 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CD8BP10966 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CD8BP10966 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CD8BP10966 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CD8BP10966 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CD8BP10966 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CD8BP10966 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CD8BP10966 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CD8BP10966 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CD8BP10966 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CD8BP10966 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CD8BP10966 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CD8BP10966 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CD8BP10966 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CD8BP10966 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CD8BP10966 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CD8BP10966 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CD8BP10966 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CD8BP10966 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CD8BP10966 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CD8BP10966 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CD8BP10966 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CD8BP10966 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CD8BP10966 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CD8BP10966 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CD8BP10966 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CD8BP10966 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CD8BP10966 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CD8BP10966 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CD8BP10966 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CD8BP10966 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CD8BP10966 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CD8BP10966 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CD8BP10966 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CD8BP10966 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CD8BP10966 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CD8BP10966 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CD8BP10966 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CD8BP10966 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CD8BP10966 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CD8BP10966 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CD8BP10966 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CD8BP10966 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CD8BP10966 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CD8BP10966 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CD8BP10966 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CD8BP10966 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CD8BP10966 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CD8BP10966 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CD8BP10966 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CD8BP10966 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CD8BP10966 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CD8BP10966 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CD8BP10966 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CD8BP10966 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms