Protein–RNA interactions for Protein: P10720

PF4V1, Platelet factor 4 variant, humanhuman

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4V1P10720 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PF4V1P10720 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PF4V1P10720 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PF4V1P10720 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PF4V1P10720 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PF4V1P10720 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PF4V1P10720 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PF4V1P10720 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PF4V1P10720 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PF4V1P10720 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PF4V1P10720 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PF4V1P10720 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PF4V1P10720 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PF4V1P10720 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PF4V1P10720 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PF4V1P10720 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PF4V1P10720 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PF4V1P10720 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PF4V1P10720 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PF4V1P10720 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PF4V1P10720 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PF4V1P10720 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PF4V1P10720 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PF4V1P10720 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PF4V1P10720 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PF4V1P10720 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PF4V1P10720 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PF4V1P10720 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PF4V1P10720 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PF4V1P10720 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PF4V1P10720 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PF4V1P10720 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PF4V1P10720 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PF4V1P10720 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PF4V1P10720 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PF4V1P10720 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PF4V1P10720 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PF4V1P10720 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PF4V1P10720 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PF4V1P10720 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PF4V1P10720 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PF4V1P10720 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PF4V1P10720 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PF4V1P10720 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PF4V1P10720 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PF4V1P10720 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PF4V1P10720 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PF4V1P10720 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PF4V1P10720 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PF4V1P10720 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PF4V1P10720 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PF4V1P10720 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PF4V1P10720 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PF4V1P10720 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PF4V1P10720 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PF4V1P10720 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PF4V1P10720 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PF4V1P10720 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PF4V1P10720 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PF4V1P10720 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PF4V1P10720 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PF4V1P10720 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PF4V1P10720 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PF4V1P10720 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PF4V1P10720 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PF4V1P10720 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PF4V1P10720 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PF4V1P10720 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PF4V1P10720 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PF4V1P10720 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PF4V1P10720 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PF4V1P10720 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PF4V1P10720 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PF4V1P10720 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PF4V1P10720 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PF4V1P10720 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PF4V1P10720 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PF4V1P10720 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PF4V1P10720 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PF4V1P10720 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PF4V1P10720 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PF4V1P10720 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PF4V1P10720 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PF4V1P10720 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PF4V1P10720 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PF4V1P10720 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PF4V1P10720 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PF4V1P10720 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PF4V1P10720 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PF4V1P10720 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PF4V1P10720 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PF4V1P10720 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PF4V1P10720 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PF4V1P10720 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PF4V1P10720 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PF4V1P10720 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PF4V1P10720 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PF4V1P10720 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PF4V1P10720 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PF4V1P10720 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms