Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HKR1P10072 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HKR1P10072 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HKR1P10072 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HKR1P10072 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HKR1P10072 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HKR1P10072 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HKR1P10072 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HKR1P10072 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HKR1P10072 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HKR1P10072 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HKR1P10072 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
HKR1P10072 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HKR1P10072 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HKR1P10072 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HKR1P10072 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HKR1P10072 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HKR1P10072 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HKR1P10072 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HKR1P10072 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HKR1P10072 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HKR1P10072 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HKR1P10072 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HKR1P10072 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HKR1P10072 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HKR1P10072 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HKR1P10072 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HKR1P10072 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HKR1P10072 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HKR1P10072 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HKR1P10072 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
HKR1P10072 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HKR1P10072 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HKR1P10072 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HKR1P10072 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HKR1P10072 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HKR1P10072 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HKR1P10072 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HKR1P10072 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HKR1P10072 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HKR1P10072 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HKR1P10072 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HKR1P10072 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HKR1P10072 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HKR1P10072 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HKR1P10072 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HKR1P10072 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HKR1P10072 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HKR1P10072 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HKR1P10072 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HKR1P10072 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HKR1P10072 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HKR1P10072 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HKR1P10072 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HKR1P10072 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HKR1P10072 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HKR1P10072 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HKR1P10072 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HKR1P10072 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HKR1P10072 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HKR1P10072 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HKR1P10072 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HKR1P10072 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HKR1P10072 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
HKR1P10072 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HKR1P10072 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HKR1P10072 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HKR1P10072 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HKR1P10072 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HKR1P10072 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HKR1P10072 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HKR1P10072 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HKR1P10072 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HKR1P10072 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HKR1P10072 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HKR1P10072 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HKR1P10072 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HKR1P10072 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HKR1P10072 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HKR1P10072 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HKR1P10072 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HKR1P10072 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HKR1P10072 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
HKR1P10072 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HKR1P10072 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HKR1P10072 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HKR1P10072 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
HKR1P10072 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HKR1P10072 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
HKR1P10072 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HKR1P10072 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HKR1P10072 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HKR1P10072 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HKR1P10072 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HKR1P10072 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HKR1P10072 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HKR1P10072 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HKR1P10072 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HKR1P10072 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HKR1P10072 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms