Protein–RNA interactions for Protein: P0DMP2

SRGAP2B, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2BP0DMP2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRGAP2BP0DMP2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRGAP2BP0DMP2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRGAP2BP0DMP2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRGAP2BP0DMP2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SRGAP2BP0DMP2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRGAP2BP0DMP2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SRGAP2BP0DMP2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRGAP2BP0DMP2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SRGAP2BP0DMP2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRGAP2BP0DMP2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRGAP2BP0DMP2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRGAP2BP0DMP2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRGAP2BP0DMP2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRGAP2BP0DMP2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SRGAP2BP0DMP2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRGAP2BP0DMP2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRGAP2BP0DMP2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRGAP2BP0DMP2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRGAP2BP0DMP2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRGAP2BP0DMP2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SRGAP2BP0DMP2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRGAP2BP0DMP2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRGAP2BP0DMP2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRGAP2BP0DMP2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRGAP2BP0DMP2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRGAP2BP0DMP2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRGAP2BP0DMP2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRGAP2BP0DMP2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRGAP2BP0DMP2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRGAP2BP0DMP2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRGAP2BP0DMP2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRGAP2BP0DMP2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRGAP2BP0DMP2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRGAP2BP0DMP2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SRGAP2BP0DMP2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRGAP2BP0DMP2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRGAP2BP0DMP2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRGAP2BP0DMP2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRGAP2BP0DMP2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRGAP2BP0DMP2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRGAP2BP0DMP2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRGAP2BP0DMP2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRGAP2BP0DMP2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRGAP2BP0DMP2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRGAP2BP0DMP2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRGAP2BP0DMP2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRGAP2BP0DMP2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRGAP2BP0DMP2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRGAP2BP0DMP2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRGAP2BP0DMP2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRGAP2BP0DMP2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRGAP2BP0DMP2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRGAP2BP0DMP2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRGAP2BP0DMP2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SRGAP2BP0DMP2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRGAP2BP0DMP2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRGAP2BP0DMP2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRGAP2BP0DMP2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRGAP2BP0DMP2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SRGAP2BP0DMP2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRGAP2BP0DMP2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRGAP2BP0DMP2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRGAP2BP0DMP2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SRGAP2BP0DMP2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SRGAP2BP0DMP2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SRGAP2BP0DMP2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRGAP2BP0DMP2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SRGAP2BP0DMP2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRGAP2BP0DMP2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRGAP2BP0DMP2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRGAP2BP0DMP2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRGAP2BP0DMP2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRGAP2BP0DMP2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRGAP2BP0DMP2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRGAP2BP0DMP2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SRGAP2BP0DMP2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRGAP2BP0DMP2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRGAP2BP0DMP2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRGAP2BP0DMP2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRGAP2BP0DMP2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRGAP2BP0DMP2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRGAP2BP0DMP2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRGAP2BP0DMP2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRGAP2BP0DMP2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRGAP2BP0DMP2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRGAP2BP0DMP2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRGAP2BP0DMP2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRGAP2BP0DMP2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRGAP2BP0DMP2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRGAP2BP0DMP2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRGAP2BP0DMP2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRGAP2BP0DMP2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRGAP2BP0DMP2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRGAP2BP0DMP2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRGAP2BP0DMP2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRGAP2BP0DMP2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRGAP2BP0DMP2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRGAP2BP0DMP2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRGAP2BP0DMP2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms