Protein–RNA interactions for Protein: P0DJ93

SMIM13, Small integral membrane protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM13P0DJ93 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM13P0DJ93 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM13P0DJ93 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM13P0DJ93 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM13P0DJ93 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM13P0DJ93 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM13P0DJ93 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM13P0DJ93 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM13P0DJ93 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM13P0DJ93 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM13P0DJ93 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM13P0DJ93 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM13P0DJ93 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM13P0DJ93 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM13P0DJ93 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM13P0DJ93 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM13P0DJ93 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM13P0DJ93 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM13P0DJ93 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM13P0DJ93 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM13P0DJ93 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM13P0DJ93 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM13P0DJ93 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SMIM13P0DJ93 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM13P0DJ93 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM13P0DJ93 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM13P0DJ93 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM13P0DJ93 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM13P0DJ93 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM13P0DJ93 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM13P0DJ93 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM13P0DJ93 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM13P0DJ93 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM13P0DJ93 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM13P0DJ93 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM13P0DJ93 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM13P0DJ93 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM13P0DJ93 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM13P0DJ93 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM13P0DJ93 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM13P0DJ93 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM13P0DJ93 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM13P0DJ93 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM13P0DJ93 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM13P0DJ93 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM13P0DJ93 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM13P0DJ93 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM13P0DJ93 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM13P0DJ93 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM13P0DJ93 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM13P0DJ93 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM13P0DJ93 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM13P0DJ93 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM13P0DJ93 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM13P0DJ93 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM13P0DJ93 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM13P0DJ93 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM13P0DJ93 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM13P0DJ93 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM13P0DJ93 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM13P0DJ93 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM13P0DJ93 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM13P0DJ93 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM13P0DJ93 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM13P0DJ93 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM13P0DJ93 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM13P0DJ93 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM13P0DJ93 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM13P0DJ93 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM13P0DJ93 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM13P0DJ93 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM13P0DJ93 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM13P0DJ93 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM13P0DJ93 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM13P0DJ93 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM13P0DJ93 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM13P0DJ93 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM13P0DJ93 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM13P0DJ93 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM13P0DJ93 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM13P0DJ93 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM13P0DJ93 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM13P0DJ93 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM13P0DJ93 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM13P0DJ93 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM13P0DJ93 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM13P0DJ93 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM13P0DJ93 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM13P0DJ93 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM13P0DJ93 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM13P0DJ93 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM13P0DJ93 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM13P0DJ93 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM13P0DJ93 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM13P0DJ93 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM13P0DJ93 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM13P0DJ93 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM13P0DJ93 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms