Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CT47B1P0C2W7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CT47B1P0C2W7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CT47B1P0C2W7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CT47B1P0C2W7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CT47B1P0C2W7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CT47B1P0C2W7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CT47B1P0C2W7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CT47B1P0C2W7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CT47B1P0C2W7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CT47B1P0C2W7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
CT47B1P0C2W7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
CT47B1P0C2W7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CT47B1P0C2W7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
CT47B1P0C2W7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CT47B1P0C2W7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CT47B1P0C2W7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CT47B1P0C2W7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CT47B1P0C2W7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CT47B1P0C2W7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
CT47B1P0C2W7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CT47B1P0C2W7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CT47B1P0C2W7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CT47B1P0C2W7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CT47B1P0C2W7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CT47B1P0C2W7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CT47B1P0C2W7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CT47B1P0C2W7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CT47B1P0C2W7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CT47B1P0C2W7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CT47B1P0C2W7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CT47B1P0C2W7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CT47B1P0C2W7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CT47B1P0C2W7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CT47B1P0C2W7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CT47B1P0C2W7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CT47B1P0C2W7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CT47B1P0C2W7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
CT47B1P0C2W7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CT47B1P0C2W7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CT47B1P0C2W7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CT47B1P0C2W7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CT47B1P0C2W7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CT47B1P0C2W7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CT47B1P0C2W7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CT47B1P0C2W7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CT47B1P0C2W7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CT47B1P0C2W7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CT47B1P0C2W7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CT47B1P0C2W7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CT47B1P0C2W7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CT47B1P0C2W7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CT47B1P0C2W7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CT47B1P0C2W7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CT47B1P0C2W7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CT47B1P0C2W7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CT47B1P0C2W7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CT47B1P0C2W7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CT47B1P0C2W7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CT47B1P0C2W7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CT47B1P0C2W7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CT47B1P0C2W7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CT47B1P0C2W7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CT47B1P0C2W7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CT47B1P0C2W7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CT47B1P0C2W7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CT47B1P0C2W7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CT47B1P0C2W7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CT47B1P0C2W7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CT47B1P0C2W7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CT47B1P0C2W7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CT47B1P0C2W7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CT47B1P0C2W7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CT47B1P0C2W7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CT47B1P0C2W7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CT47B1P0C2W7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CT47B1P0C2W7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CT47B1P0C2W7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CT47B1P0C2W7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CT47B1P0C2W7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CT47B1P0C2W7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CT47B1P0C2W7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CT47B1P0C2W7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CT47B1P0C2W7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CT47B1P0C2W7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CT47B1P0C2W7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CT47B1P0C2W7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
CT47B1P0C2W7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CT47B1P0C2W7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CT47B1P0C2W7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CT47B1P0C2W7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CT47B1P0C2W7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CT47B1P0C2W7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CT47B1P0C2W7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CT47B1P0C2W7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CT47B1P0C2W7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CT47B1P0C2W7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CT47B1P0C2W7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CT47B1P0C2W7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CT47B1P0C2W7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms