Protein–RNA interactions for Protein: P08729

KRT7, Keratin, type II cytoskeletal 7, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT7P08729 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT7P08729 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT7P08729 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT7P08729 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT7P08729 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT7P08729 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT7P08729 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT7P08729 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT7P08729 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT7P08729 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT7P08729 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT7P08729 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT7P08729 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT7P08729 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT7P08729 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT7P08729 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT7P08729 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT7P08729 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT7P08729 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT7P08729 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT7P08729 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT7P08729 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT7P08729 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT7P08729 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT7P08729 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT7P08729 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT7P08729 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT7P08729 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT7P08729 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT7P08729 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT7P08729 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT7P08729 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT7P08729 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT7P08729 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT7P08729 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT7P08729 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT7P08729 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT7P08729 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT7P08729 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT7P08729 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT7P08729 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT7P08729 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT7P08729 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
KRT7P08729 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT7P08729 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT7P08729 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT7P08729 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT7P08729 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT7P08729 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT7P08729 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT7P08729 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT7P08729 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT7P08729 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT7P08729 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT7P08729 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT7P08729 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT7P08729 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT7P08729 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT7P08729 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT7P08729 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT7P08729 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT7P08729 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT7P08729 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT7P08729 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT7P08729 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT7P08729 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT7P08729 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT7P08729 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT7P08729 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT7P08729 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT7P08729 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT7P08729 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT7P08729 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT7P08729 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT7P08729 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT7P08729 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT7P08729 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT7P08729 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT7P08729 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT7P08729 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT7P08729 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT7P08729 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT7P08729 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT7P08729 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT7P08729 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT7P08729 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT7P08729 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT7P08729 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT7P08729 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT7P08729 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT7P08729 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT7P08729 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT7P08729 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT7P08729 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT7P08729 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT7P08729 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT7P08729 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT7P08729 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT7P08729 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT7P08729 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms