Protein–RNA interactions for Protein: P08579

SNRPB2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPB2P08579 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRPB2P08579 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRPB2P08579 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNRPB2P08579 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNRPB2P08579 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNRPB2P08579 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNRPB2P08579 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRPB2P08579 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRPB2P08579 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRPB2P08579 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRPB2P08579 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRPB2P08579 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRPB2P08579 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRPB2P08579 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRPB2P08579 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRPB2P08579 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRPB2P08579 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRPB2P08579 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRPB2P08579 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRPB2P08579 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRPB2P08579 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRPB2P08579 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRPB2P08579 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRPB2P08579 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRPB2P08579 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRPB2P08579 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRPB2P08579 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRPB2P08579 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRPB2P08579 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRPB2P08579 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRPB2P08579 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRPB2P08579 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRPB2P08579 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRPB2P08579 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRPB2P08579 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRPB2P08579 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRPB2P08579 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRPB2P08579 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPB2P08579 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPB2P08579 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPB2P08579 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPB2P08579 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPB2P08579 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPB2P08579 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRPB2P08579 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRPB2P08579 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRPB2P08579 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRPB2P08579 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRPB2P08579 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRPB2P08579 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRPB2P08579 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRPB2P08579 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRPB2P08579 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRPB2P08579 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRPB2P08579 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRPB2P08579 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRPB2P08579 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRPB2P08579 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRPB2P08579 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRPB2P08579 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRPB2P08579 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRPB2P08579 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRPB2P08579 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRPB2P08579 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRPB2P08579 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRPB2P08579 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRPB2P08579 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRPB2P08579 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRPB2P08579 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRPB2P08579 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRPB2P08579 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRPB2P08579 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRPB2P08579 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRPB2P08579 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRPB2P08579 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRPB2P08579 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRPB2P08579 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRPB2P08579 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRPB2P08579 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRPB2P08579 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRPB2P08579 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRPB2P08579 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRPB2P08579 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRPB2P08579 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRPB2P08579 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRPB2P08579 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRPB2P08579 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRPB2P08579 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRPB2P08579 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRPB2P08579 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRPB2P08579 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRPB2P08579 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRPB2P08579 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRPB2P08579 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRPB2P08579 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRPB2P08579 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRPB2P08579 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRPB2P08579 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRPB2P08579 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRPB2P08579 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.6 ms