Protein–RNA interactions for Protein: P07949

RET, Proto-oncogene tyrosine-protein kinase receptor Ret, humanhuman

Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETP07949 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RETP07949 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RETP07949 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RETP07949 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RETP07949 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RETP07949 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RETP07949 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RETP07949 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RETP07949 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RETP07949 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RETP07949 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RETP07949 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RETP07949 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RETP07949 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RETP07949 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RETP07949 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RETP07949 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RETP07949 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RETP07949 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RETP07949 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RETP07949 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RETP07949 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RETP07949 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RETP07949 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RETP07949 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RETP07949 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RETP07949 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RETP07949 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RETP07949 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RETP07949 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RETP07949 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RETP07949 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RETP07949 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RETP07949 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RETP07949 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RETP07949 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RETP07949 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RETP07949 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RETP07949 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RETP07949 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RETP07949 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RETP07949 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RETP07949 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RETP07949 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RETP07949 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RETP07949 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RETP07949 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RETP07949 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RETP07949 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RETP07949 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RETP07949 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RETP07949 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RETP07949 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RETP07949 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RETP07949 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RETP07949 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RETP07949 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RETP07949 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RETP07949 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RETP07949 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RETP07949 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RETP07949 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RETP07949 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RETP07949 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RETP07949 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RETP07949 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RETP07949 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RETP07949 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RETP07949 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RETP07949 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RETP07949 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RETP07949 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RETP07949 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RETP07949 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RETP07949 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RETP07949 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RETP07949 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RETP07949 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RETP07949 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RETP07949 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RETP07949 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RETP07949 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RETP07949 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RETP07949 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RETP07949 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RETP07949 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RETP07949 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RETP07949 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RETP07949 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RETP07949 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RETP07949 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RETP07949 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RETP07949 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RETP07949 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RETP07949 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RETP07949 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RETP07949 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RETP07949 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RETP07949 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RETP07949 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms