Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGAVP06756 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGAVP06756 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGAVP06756 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGAVP06756 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGAVP06756 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGAVP06756 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGAVP06756 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGAVP06756 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGAVP06756 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITGAVP06756 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITGAVP06756 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITGAVP06756 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ITGAVP06756 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGAVP06756 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGAVP06756 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGAVP06756 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGAVP06756 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGAVP06756 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGAVP06756 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGAVP06756 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGAVP06756 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGAVP06756 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGAVP06756 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGAVP06756 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGAVP06756 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGAVP06756 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGAVP06756 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGAVP06756 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGAVP06756 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGAVP06756 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGAVP06756 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGAVP06756 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGAVP06756 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGAVP06756 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGAVP06756 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGAVP06756 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGAVP06756 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGAVP06756 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGAVP06756 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGAVP06756 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGAVP06756 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGAVP06756 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGAVP06756 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGAVP06756 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGAVP06756 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGAVP06756 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGAVP06756 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGAVP06756 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGAVP06756 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGAVP06756 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ITGAVP06756 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ITGAVP06756 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGAVP06756 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGAVP06756 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGAVP06756 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGAVP06756 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGAVP06756 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGAVP06756 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGAVP06756 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGAVP06756 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGAVP06756 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGAVP06756 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGAVP06756 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGAVP06756 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGAVP06756 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGAVP06756 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGAVP06756 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGAVP06756 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGAVP06756 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGAVP06756 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGAVP06756 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGAVP06756 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGAVP06756 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGAVP06756 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGAVP06756 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGAVP06756 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGAVP06756 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGAVP06756 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGAVP06756 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGAVP06756 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGAVP06756 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGAVP06756 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGAVP06756 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGAVP06756 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGAVP06756 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGAVP06756 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGAVP06756 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGAVP06756 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGAVP06756 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGAVP06756 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGAVP06756 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGAVP06756 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGAVP06756 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGAVP06756 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGAVP06756 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGAVP06756 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGAVP06756 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGAVP06756 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGAVP06756 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms