Protein–RNA interactions for Protein: P05014

IFNA4, Interferon alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA4P05014 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IFNA4P05014 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFNA4P05014 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFNA4P05014 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFNA4P05014 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFNA4P05014 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFNA4P05014 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFNA4P05014 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFNA4P05014 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFNA4P05014 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFNA4P05014 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFNA4P05014 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFNA4P05014 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFNA4P05014 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFNA4P05014 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFNA4P05014 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFNA4P05014 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFNA4P05014 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFNA4P05014 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFNA4P05014 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFNA4P05014 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFNA4P05014 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFNA4P05014 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFNA4P05014 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFNA4P05014 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFNA4P05014 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFNA4P05014 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFNA4P05014 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFNA4P05014 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFNA4P05014 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFNA4P05014 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFNA4P05014 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFNA4P05014 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IFNA4P05014 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IFNA4P05014 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IFNA4P05014 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IFNA4P05014 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IFNA4P05014 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IFNA4P05014 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IFNA4P05014 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IFNA4P05014 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IFNA4P05014 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IFNA4P05014 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IFNA4P05014 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IFNA4P05014 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IFNA4P05014 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IFNA4P05014 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IFNA4P05014 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IFNA4P05014 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IFNA4P05014 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IFNA4P05014 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
IFNA4P05014 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
IFNA4P05014 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
IFNA4P05014 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
IFNA4P05014 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
IFNA4P05014 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
IFNA4P05014 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
IFNA4P05014 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
IFNA4P05014 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IFNA4P05014 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IFNA4P05014 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IFNA4P05014 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IFNA4P05014 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IFNA4P05014 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IFNA4P05014 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IFNA4P05014 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IFNA4P05014 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IFNA4P05014 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IFNA4P05014 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IFNA4P05014 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IFNA4P05014 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IFNA4P05014 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IFNA4P05014 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IFNA4P05014 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IFNA4P05014 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IFNA4P05014 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IFNA4P05014 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IFNA4P05014 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IFNA4P05014 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IFNA4P05014 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IFNA4P05014 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IFNA4P05014 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IFNA4P05014 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IFNA4P05014 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IFNA4P05014 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IFNA4P05014 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFNA4P05014 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFNA4P05014 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFNA4P05014 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFNA4P05014 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFNA4P05014 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFNA4P05014 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFNA4P05014 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFNA4P05014 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFNA4P05014 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFNA4P05014 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFNA4P05014 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFNA4P05014 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFNA4P05014 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFNA4P05014 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms