Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOC1P02654 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOC1P02654 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
APOC1P02654 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOC1P02654 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOC1P02654 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOC1P02654 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOC1P02654 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOC1P02654 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOC1P02654 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOC1P02654 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOC1P02654 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOC1P02654 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOC1P02654 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOC1P02654 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOC1P02654 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOC1P02654 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOC1P02654 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOC1P02654 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOC1P02654 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOC1P02654 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOC1P02654 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOC1P02654 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOC1P02654 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOC1P02654 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
APOC1P02654 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOC1P02654 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOC1P02654 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOC1P02654 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOC1P02654 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOC1P02654 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOC1P02654 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOC1P02654 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOC1P02654 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
APOC1P02654 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOC1P02654 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOC1P02654 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOC1P02654 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOC1P02654 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOC1P02654 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
APOC1P02654 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
APOC1P02654 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOC1P02654 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOC1P02654 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOC1P02654 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOC1P02654 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
APOC1P02654 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOC1P02654 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOC1P02654 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOC1P02654 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOC1P02654 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOC1P02654 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
APOC1P02654 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOC1P02654 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOC1P02654 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOC1P02654 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOC1P02654 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOC1P02654 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOC1P02654 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
APOC1P02654 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOC1P02654 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOC1P02654 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOC1P02654 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOC1P02654 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOC1P02654 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOC1P02654 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOC1P02654 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
APOC1P02654 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOC1P02654 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOC1P02654 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOC1P02654 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOC1P02654 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOC1P02654 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOC1P02654 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOC1P02654 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOC1P02654 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOC1P02654 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOC1P02654 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOC1P02654 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOC1P02654 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOC1P02654 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOC1P02654 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOC1P02654 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOC1P02654 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOC1P02654 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOC1P02654 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOC1P02654 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
APOC1P02654 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOC1P02654 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOC1P02654 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOC1P02654 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOC1P02654 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOC1P02654 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOC1P02654 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOC1P02654 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOC1P02654 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
APOC1P02654 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOC1P02654 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOC1P02654 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOC1P02654 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms