Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX4O95219 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX4O95219 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX4O95219 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX4O95219 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX4O95219 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX4O95219 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX4O95219 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX4O95219 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX4O95219 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX4O95219 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX4O95219 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX4O95219 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX4O95219 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX4O95219 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX4O95219 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX4O95219 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX4O95219 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX4O95219 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX4O95219 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX4O95219 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX4O95219 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX4O95219 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX4O95219 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX4O95219 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX4O95219 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX4O95219 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX4O95219 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX4O95219 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX4O95219 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX4O95219 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX4O95219 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX4O95219 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX4O95219 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX4O95219 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX4O95219 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX4O95219 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX4O95219 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX4O95219 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX4O95219 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX4O95219 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX4O95219 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX4O95219 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX4O95219 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX4O95219 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX4O95219 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX4O95219 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX4O95219 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX4O95219 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX4O95219 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX4O95219 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX4O95219 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX4O95219 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX4O95219 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX4O95219 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX4O95219 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX4O95219 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX4O95219 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX4O95219 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX4O95219 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX4O95219 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX4O95219 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX4O95219 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX4O95219 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX4O95219 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX4O95219 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX4O95219 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX4O95219 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX4O95219 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX4O95219 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX4O95219 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX4O95219 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX4O95219 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX4O95219 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX4O95219 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX4O95219 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX4O95219 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX4O95219 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX4O95219 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX4O95219 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX4O95219 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX4O95219 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX4O95219 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX4O95219 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX4O95219 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX4O95219 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX4O95219 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX4O95219 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX4O95219 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX4O95219 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX4O95219 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX4O95219 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX4O95219 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX4O95219 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX4O95219 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX4O95219 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX4O95219 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX4O95219 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX4O95219 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX4O95219 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms