Protein–RNA interactions for Protein: O95155

UBE4B, Ubiquitin conjugation factor E4 B, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4BO95155 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBE4BO95155 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBE4BO95155 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
UBE4BO95155 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
UBE4BO95155 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE4BO95155 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE4BO95155 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE4BO95155 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE4BO95155 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE4BO95155 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE4BO95155 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE4BO95155 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE4BO95155 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE4BO95155 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE4BO95155 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE4BO95155 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE4BO95155 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE4BO95155 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE4BO95155 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE4BO95155 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE4BO95155 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE4BO95155 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE4BO95155 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE4BO95155 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE4BO95155 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBE4BO95155 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBE4BO95155 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBE4BO95155 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBE4BO95155 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBE4BO95155 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBE4BO95155 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBE4BO95155 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBE4BO95155 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBE4BO95155 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBE4BO95155 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
UBE4BO95155 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBE4BO95155 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBE4BO95155 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBE4BO95155 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBE4BO95155 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
UBE4BO95155 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
UBE4BO95155 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
UBE4BO95155 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBE4BO95155 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBE4BO95155 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
UBE4BO95155 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBE4BO95155 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBE4BO95155 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBE4BO95155 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE4BO95155 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE4BO95155 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE4BO95155 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE4BO95155 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE4BO95155 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE4BO95155 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE4BO95155 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE4BO95155 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE4BO95155 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE4BO95155 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE4BO95155 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE4BO95155 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE4BO95155 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE4BO95155 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE4BO95155 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE4BO95155 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE4BO95155 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE4BO95155 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE4BO95155 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE4BO95155 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE4BO95155 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE4BO95155 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE4BO95155 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE4BO95155 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE4BO95155 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE4BO95155 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE4BO95155 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE4BO95155 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE4BO95155 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE4BO95155 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE4BO95155 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE4BO95155 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE4BO95155 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE4BO95155 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE4BO95155 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE4BO95155 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE4BO95155 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE4BO95155 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE4BO95155 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE4BO95155 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE4BO95155 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE4BO95155 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE4BO95155 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE4BO95155 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE4BO95155 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE4BO95155 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE4BO95155 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE4BO95155 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE4BO95155 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE4BO95155 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE4BO95155 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms