Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SKAP2O75563 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SKAP2O75563 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SKAP2O75563 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SKAP2O75563 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SKAP2O75563 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SKAP2O75563 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SKAP2O75563 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SKAP2O75563 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SKAP2O75563 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SKAP2O75563 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SKAP2O75563 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SKAP2O75563 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SKAP2O75563 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SKAP2O75563 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SKAP2O75563 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SKAP2O75563 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SKAP2O75563 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SKAP2O75563 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SKAP2O75563 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SKAP2O75563 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SKAP2O75563 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SKAP2O75563 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SKAP2O75563 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SKAP2O75563 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKAP2O75563 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SKAP2O75563 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SKAP2O75563 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKAP2O75563 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKAP2O75563 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKAP2O75563 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKAP2O75563 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKAP2O75563 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKAP2O75563 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKAP2O75563 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKAP2O75563 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKAP2O75563 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKAP2O75563 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKAP2O75563 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKAP2O75563 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKAP2O75563 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKAP2O75563 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKAP2O75563 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKAP2O75563 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKAP2O75563 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKAP2O75563 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKAP2O75563 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKAP2O75563 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SKAP2O75563 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKAP2O75563 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKAP2O75563 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKAP2O75563 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKAP2O75563 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKAP2O75563 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SKAP2O75563 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SKAP2O75563 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKAP2O75563 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKAP2O75563 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SKAP2O75563 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKAP2O75563 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKAP2O75563 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKAP2O75563 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKAP2O75563 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKAP2O75563 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SKAP2O75563 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKAP2O75563 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKAP2O75563 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKAP2O75563 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SKAP2O75563 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKAP2O75563 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKAP2O75563 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKAP2O75563 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKAP2O75563 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKAP2O75563 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKAP2O75563 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKAP2O75563 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKAP2O75563 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKAP2O75563 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKAP2O75563 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKAP2O75563 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKAP2O75563 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKAP2O75563 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKAP2O75563 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKAP2O75563 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKAP2O75563 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKAP2O75563 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKAP2O75563 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKAP2O75563 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKAP2O75563 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKAP2O75563 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKAP2O75563 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKAP2O75563 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKAP2O75563 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKAP2O75563 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKAP2O75563 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKAP2O75563 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKAP2O75563 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKAP2O75563 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKAP2O75563 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKAP2O75563 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms