Protein–RNA interactions for Protein: O75334

PPFIA2, Liprin-alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA2O75334 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PPFIA2O75334 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPFIA2O75334 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPFIA2O75334 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PPFIA2O75334 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPFIA2O75334 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPFIA2O75334 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPFIA2O75334 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPFIA2O75334 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PPFIA2O75334 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPFIA2O75334 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPFIA2O75334 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPFIA2O75334 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPFIA2O75334 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPFIA2O75334 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPFIA2O75334 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPFIA2O75334 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPFIA2O75334 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPFIA2O75334 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPFIA2O75334 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPFIA2O75334 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPFIA2O75334 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPFIA2O75334 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPFIA2O75334 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPFIA2O75334 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPFIA2O75334 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPFIA2O75334 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPFIA2O75334 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPFIA2O75334 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPFIA2O75334 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPFIA2O75334 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPFIA2O75334 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPFIA2O75334 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPFIA2O75334 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPFIA2O75334 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPFIA2O75334 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPFIA2O75334 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPFIA2O75334 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PPFIA2O75334 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPFIA2O75334 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPFIA2O75334 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPFIA2O75334 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPFIA2O75334 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPFIA2O75334 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPFIA2O75334 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPFIA2O75334 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPFIA2O75334 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPFIA2O75334 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPFIA2O75334 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPFIA2O75334 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPFIA2O75334 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPFIA2O75334 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPFIA2O75334 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPFIA2O75334 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPFIA2O75334 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPFIA2O75334 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPFIA2O75334 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPFIA2O75334 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPFIA2O75334 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPFIA2O75334 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PPFIA2O75334 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PPFIA2O75334 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPFIA2O75334 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPFIA2O75334 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PPFIA2O75334 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPFIA2O75334 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPFIA2O75334 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPFIA2O75334 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPFIA2O75334 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPFIA2O75334 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPFIA2O75334 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPFIA2O75334 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPFIA2O75334 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPFIA2O75334 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPFIA2O75334 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPFIA2O75334 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPFIA2O75334 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPFIA2O75334 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPFIA2O75334 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPFIA2O75334 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPFIA2O75334 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPFIA2O75334 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPFIA2O75334 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPFIA2O75334 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPFIA2O75334 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPFIA2O75334 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPFIA2O75334 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPFIA2O75334 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPFIA2O75334 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPFIA2O75334 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPFIA2O75334 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PPFIA2O75334 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPFIA2O75334 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PPFIA2O75334 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPFIA2O75334 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPFIA2O75334 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPFIA2O75334 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPFIA2O75334 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPFIA2O75334 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPFIA2O75334 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms