Protein–RNA interactions for Protein: O60662

KLHL41, Kelch-like protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL41O60662 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL41O60662 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL41O60662 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL41O60662 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL41O60662 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL41O60662 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL41O60662 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL41O60662 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL41O60662 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL41O60662 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL41O60662 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL41O60662 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL41O60662 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL41O60662 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL41O60662 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL41O60662 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL41O60662 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL41O60662 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL41O60662 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL41O60662 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL41O60662 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL41O60662 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL41O60662 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL41O60662 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL41O60662 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL41O60662 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL41O60662 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL41O60662 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL41O60662 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL41O60662 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL41O60662 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL41O60662 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL41O60662 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL41O60662 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL41O60662 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL41O60662 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL41O60662 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL41O60662 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL41O60662 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL41O60662 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL41O60662 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL41O60662 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL41O60662 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL41O60662 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL41O60662 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL41O60662 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL41O60662 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL41O60662 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL41O60662 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL41O60662 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL41O60662 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL41O60662 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL41O60662 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL41O60662 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL41O60662 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL41O60662 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL41O60662 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL41O60662 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL41O60662 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL41O60662 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL41O60662 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL41O60662 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL41O60662 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL41O60662 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL41O60662 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL41O60662 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL41O60662 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL41O60662 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL41O60662 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL41O60662 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL41O60662 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL41O60662 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL41O60662 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL41O60662 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL41O60662 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL41O60662 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL41O60662 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL41O60662 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KLHL41O60662 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL41O60662 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL41O60662 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL41O60662 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL41O60662 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL41O60662 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL41O60662 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL41O60662 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL41O60662 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL41O60662 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL41O60662 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL41O60662 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL41O60662 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL41O60662 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL41O60662 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL41O60662 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL41O60662 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL41O60662 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL41O60662 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL41O60662 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL41O60662 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL41O60662 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms