Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP9BO43861 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP9BO43861 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP9BO43861 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP9BO43861 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP9BO43861 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP9BO43861 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP9BO43861 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP9BO43861 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP9BO43861 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP9BO43861 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP9BO43861 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP9BO43861 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP9BO43861 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP9BO43861 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ATP9BO43861 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP9BO43861 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP9BO43861 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP9BO43861 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP9BO43861 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP9BO43861 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP9BO43861 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP9BO43861 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP9BO43861 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP9BO43861 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP9BO43861 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP9BO43861 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP9BO43861 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP9BO43861 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP9BO43861 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP9BO43861 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP9BO43861 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP9BO43861 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP9BO43861 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP9BO43861 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP9BO43861 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP9BO43861 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP9BO43861 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP9BO43861 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP9BO43861 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP9BO43861 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP9BO43861 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP9BO43861 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP9BO43861 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP9BO43861 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP9BO43861 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP9BO43861 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP9BO43861 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP9BO43861 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP9BO43861 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP9BO43861 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP9BO43861 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP9BO43861 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP9BO43861 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP9BO43861 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP9BO43861 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP9BO43861 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP9BO43861 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP9BO43861 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP9BO43861 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP9BO43861 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP9BO43861 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP9BO43861 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP9BO43861 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP9BO43861 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP9BO43861 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP9BO43861 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP9BO43861 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP9BO43861 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP9BO43861 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP9BO43861 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP9BO43861 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP9BO43861 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP9BO43861 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP9BO43861 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP9BO43861 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP9BO43861 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP9BO43861 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP9BO43861 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP9BO43861 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP9BO43861 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP9BO43861 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP9BO43861 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP9BO43861 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP9BO43861 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP9BO43861 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP9BO43861 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP9BO43861 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP9BO43861 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP9BO43861 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP9BO43861 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP9BO43861 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP9BO43861 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP9BO43861 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP9BO43861 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP9BO43861 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP9BO43861 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP9BO43861 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP9BO43861 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP9BO43861 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms