Protein–RNA interactions for Protein: O43818

RRP9, U3 small nucleolar RNA-interacting protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP9O43818 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRP9O43818 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRP9O43818 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRP9O43818 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRP9O43818 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRP9O43818 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRP9O43818 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRP9O43818 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRP9O43818 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRP9O43818 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRP9O43818 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RRP9O43818 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RRP9O43818 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RRP9O43818 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RRP9O43818 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RRP9O43818 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RRP9O43818 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RRP9O43818 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRP9O43818 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRP9O43818 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRP9O43818 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRP9O43818 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRP9O43818 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRP9O43818 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRP9O43818 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRP9O43818 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRP9O43818 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRP9O43818 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRP9O43818 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRP9O43818 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRP9O43818 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRP9O43818 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRP9O43818 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRP9O43818 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRP9O43818 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRP9O43818 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRP9O43818 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRP9O43818 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRP9O43818 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRP9O43818 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRP9O43818 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRP9O43818 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRP9O43818 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRP9O43818 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRP9O43818 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRP9O43818 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRP9O43818 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRP9O43818 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRP9O43818 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRP9O43818 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRP9O43818 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRP9O43818 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRP9O43818 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRP9O43818 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRP9O43818 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RRP9O43818 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RRP9O43818 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRP9O43818 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRP9O43818 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRP9O43818 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRP9O43818 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRP9O43818 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRP9O43818 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRP9O43818 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRP9O43818 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRP9O43818 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRP9O43818 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRP9O43818 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRP9O43818 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRP9O43818 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRP9O43818 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRP9O43818 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRP9O43818 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRP9O43818 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRP9O43818 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRP9O43818 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRP9O43818 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRP9O43818 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRP9O43818 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRP9O43818 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRP9O43818 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRP9O43818 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRP9O43818 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRP9O43818 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRP9O43818 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRP9O43818 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRP9O43818 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRP9O43818 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRP9O43818 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRP9O43818 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRP9O43818 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRP9O43818 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRP9O43818 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRP9O43818 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRP9O43818 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRP9O43818 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRP9O43818 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRP9O43818 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRP9O43818 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRP9O43818 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms