Protein–RNA interactions for Protein: O43795

MYO1B, Unconventional myosin-Ib, humanhuman

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1BO43795 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MYO1BO43795 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MYO1BO43795 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MYO1BO43795 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MYO1BO43795 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MYO1BO43795 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MYO1BO43795 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MYO1BO43795 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MYO1BO43795 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MYO1BO43795 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MYO1BO43795 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MYO1BO43795 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
MYO1BO43795 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MYO1BO43795 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MYO1BO43795 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MYO1BO43795 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MYO1BO43795 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MYO1BO43795 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MYO1BO43795 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MYO1BO43795 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
MYO1BO43795 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MYO1BO43795 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MYO1BO43795 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MYO1BO43795 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
MYO1BO43795 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
MYO1BO43795 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MYO1BO43795 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MYO1BO43795 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MYO1BO43795 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MYO1BO43795 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MYO1BO43795 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MYO1BO43795 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MYO1BO43795 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MYO1BO43795 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MYO1BO43795 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MYO1BO43795 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MYO1BO43795 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
MYO1BO43795 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MYO1BO43795 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MYO1BO43795 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MYO1BO43795 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
MYO1BO43795 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MYO1BO43795 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MYO1BO43795 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
MYO1BO43795 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MYO1BO43795 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
MYO1BO43795 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MYO1BO43795 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MYO1BO43795 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MYO1BO43795 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MYO1BO43795 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MYO1BO43795 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MYO1BO43795 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MYO1BO43795 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MYO1BO43795 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MYO1BO43795 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MYO1BO43795 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MYO1BO43795 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MYO1BO43795 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MYO1BO43795 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MYO1BO43795 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MYO1BO43795 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MYO1BO43795 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MYO1BO43795 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MYO1BO43795 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MYO1BO43795 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
MYO1BO43795 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MYO1BO43795 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MYO1BO43795 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MYO1BO43795 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MYO1BO43795 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MYO1BO43795 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MYO1BO43795 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MYO1BO43795 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MYO1BO43795 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MYO1BO43795 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MYO1BO43795 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MYO1BO43795 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MYO1BO43795 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MYO1BO43795 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MYO1BO43795 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MYO1BO43795 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
MYO1BO43795 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MYO1BO43795 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MYO1BO43795 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MYO1BO43795 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MYO1BO43795 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MYO1BO43795 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MYO1BO43795 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MYO1BO43795 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MYO1BO43795 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
MYO1BO43795 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MYO1BO43795 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MYO1BO43795 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MYO1BO43795 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MYO1BO43795 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MYO1BO43795 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MYO1BO43795 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
MYO1BO43795 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MYO1BO43795 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms