Protein–RNA interactions for Protein: O43463

SUV39H1, Histone-lysine N-methyltransferase SUV39H1, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUV39H1O43463 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SUV39H1O43463 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SUV39H1O43463 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SUV39H1O43463 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUV39H1O43463 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUV39H1O43463 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUV39H1O43463 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUV39H1O43463 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUV39H1O43463 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUV39H1O43463 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SUV39H1O43463 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SUV39H1O43463 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUV39H1O43463 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SUV39H1O43463 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SUV39H1O43463 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUV39H1O43463 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUV39H1O43463 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SUV39H1O43463 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUV39H1O43463 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUV39H1O43463 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUV39H1O43463 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUV39H1O43463 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUV39H1O43463 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUV39H1O43463 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUV39H1O43463 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUV39H1O43463 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUV39H1O43463 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUV39H1O43463 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUV39H1O43463 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUV39H1O43463 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUV39H1O43463 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUV39H1O43463 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUV39H1O43463 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUV39H1O43463 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUV39H1O43463 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUV39H1O43463 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUV39H1O43463 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUV39H1O43463 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SUV39H1O43463 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUV39H1O43463 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUV39H1O43463 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUV39H1O43463 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUV39H1O43463 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUV39H1O43463 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUV39H1O43463 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUV39H1O43463 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUV39H1O43463 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUV39H1O43463 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUV39H1O43463 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUV39H1O43463 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUV39H1O43463 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUV39H1O43463 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUV39H1O43463 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUV39H1O43463 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SUV39H1O43463 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUV39H1O43463 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUV39H1O43463 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUV39H1O43463 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUV39H1O43463 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUV39H1O43463 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUV39H1O43463 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUV39H1O43463 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUV39H1O43463 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUV39H1O43463 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SUV39H1O43463 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUV39H1O43463 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUV39H1O43463 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUV39H1O43463 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUV39H1O43463 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SUV39H1O43463 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SUV39H1O43463 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUV39H1O43463 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUV39H1O43463 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUV39H1O43463 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUV39H1O43463 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUV39H1O43463 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUV39H1O43463 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUV39H1O43463 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUV39H1O43463 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUV39H1O43463 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SUV39H1O43463 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUV39H1O43463 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUV39H1O43463 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUV39H1O43463 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUV39H1O43463 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUV39H1O43463 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUV39H1O43463 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUV39H1O43463 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUV39H1O43463 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUV39H1O43463 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SUV39H1O43463 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUV39H1O43463 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUV39H1O43463 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUV39H1O43463 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUV39H1O43463 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUV39H1O43463 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUV39H1O43463 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUV39H1O43463 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUV39H1O43463 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUV39H1O43463 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms