Protein–RNA interactions for Protein: O00422

SAP18, Histone deacetylase complex subunit SAP18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAP18O00422 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAP18O00422 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAP18O00422 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAP18O00422 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAP18O00422 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAP18O00422 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAP18O00422 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAP18O00422 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAP18O00422 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAP18O00422 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SAP18O00422 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAP18O00422 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAP18O00422 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAP18O00422 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAP18O00422 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAP18O00422 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAP18O00422 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAP18O00422 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAP18O00422 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAP18O00422 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAP18O00422 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SAP18O00422 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAP18O00422 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAP18O00422 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SAP18O00422 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAP18O00422 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAP18O00422 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAP18O00422 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAP18O00422 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAP18O00422 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAP18O00422 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAP18O00422 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SAP18O00422 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAP18O00422 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SAP18O00422 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SAP18O00422 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAP18O00422 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAP18O00422 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAP18O00422 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAP18O00422 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAP18O00422 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAP18O00422 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAP18O00422 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAP18O00422 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAP18O00422 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAP18O00422 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAP18O00422 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAP18O00422 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAP18O00422 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAP18O00422 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAP18O00422 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAP18O00422 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAP18O00422 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SAP18O00422 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SAP18O00422 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAP18O00422 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAP18O00422 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAP18O00422 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAP18O00422 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SAP18O00422 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAP18O00422 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAP18O00422 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAP18O00422 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAP18O00422 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAP18O00422 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAP18O00422 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAP18O00422 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SAP18O00422 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAP18O00422 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAP18O00422 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAP18O00422 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAP18O00422 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAP18O00422 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAP18O00422 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAP18O00422 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAP18O00422 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAP18O00422 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAP18O00422 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SAP18O00422 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAP18O00422 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAP18O00422 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAP18O00422 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAP18O00422 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAP18O00422 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAP18O00422 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAP18O00422 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAP18O00422 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAP18O00422 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAP18O00422 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAP18O00422 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAP18O00422 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAP18O00422 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAP18O00422 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAP18O00422 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAP18O00422 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAP18O00422 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SAP18O00422 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SAP18O00422 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SAP18O00422 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SAP18O00422 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms