Protein–RNA interactions for Protein: O00303

EIF3F, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3FO00303 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF3FO00303 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF3FO00303 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF3FO00303 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF3FO00303 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF3FO00303 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF3FO00303 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
EIF3FO00303 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF3FO00303 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF3FO00303 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF3FO00303 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF3FO00303 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF3FO00303 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF3FO00303 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF3FO00303 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF3FO00303 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF3FO00303 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF3FO00303 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF3FO00303 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF3FO00303 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF3FO00303 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF3FO00303 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF3FO00303 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF3FO00303 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF3FO00303 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF3FO00303 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF3FO00303 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF3FO00303 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF3FO00303 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF3FO00303 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF3FO00303 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF3FO00303 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF3FO00303 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF3FO00303 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF3FO00303 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF3FO00303 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF3FO00303 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF3FO00303 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF3FO00303 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF3FO00303 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF3FO00303 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF3FO00303 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF3FO00303 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF3FO00303 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF3FO00303 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF3FO00303 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF3FO00303 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF3FO00303 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF3FO00303 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF3FO00303 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF3FO00303 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF3FO00303 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF3FO00303 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF3FO00303 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF3FO00303 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF3FO00303 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF3FO00303 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF3FO00303 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF3FO00303 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF3FO00303 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF3FO00303 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF3FO00303 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EIF3FO00303 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EIF3FO00303 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
EIF3FO00303 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
EIF3FO00303 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EIF3FO00303 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF3FO00303 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF3FO00303 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF3FO00303 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF3FO00303 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF3FO00303 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF3FO00303 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF3FO00303 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF3FO00303 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF3FO00303 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF3FO00303 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF3FO00303 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF3FO00303 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF3FO00303 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF3FO00303 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF3FO00303 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF3FO00303 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF3FO00303 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF3FO00303 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF3FO00303 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF3FO00303 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF3FO00303 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF3FO00303 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF3FO00303 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF3FO00303 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF3FO00303 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF3FO00303 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF3FO00303 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF3FO00303 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF3FO00303 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF3FO00303 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF3FO00303 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF3FO00303 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF3FO00303 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms