Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HIP1O00291 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HIP1O00291 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HIP1O00291 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HIP1O00291 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HIP1O00291 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HIP1O00291 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HIP1O00291 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HIP1O00291 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HIP1O00291 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HIP1O00291 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
HIP1O00291 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HIP1O00291 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HIP1O00291 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HIP1O00291 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HIP1O00291 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HIP1O00291 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HIP1O00291 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HIP1O00291 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
HIP1O00291 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HIP1O00291 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HIP1O00291 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HIP1O00291 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HIP1O00291 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HIP1O00291 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HIP1O00291 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HIP1O00291 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
HIP1O00291 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HIP1O00291 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
HIP1O00291 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HIP1O00291 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HIP1O00291 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HIP1O00291 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HIP1O00291 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HIP1O00291 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HIP1O00291 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HIP1O00291 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HIP1O00291 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HIP1O00291 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HIP1O00291 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HIP1O00291 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HIP1O00291 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HIP1O00291 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HIP1O00291 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HIP1O00291 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HIP1O00291 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HIP1O00291 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HIP1O00291 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HIP1O00291 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HIP1O00291 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HIP1O00291 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HIP1O00291 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HIP1O00291 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
HIP1O00291 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HIP1O00291 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HIP1O00291 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HIP1O00291 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HIP1O00291 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HIP1O00291 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HIP1O00291 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HIP1O00291 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HIP1O00291 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HIP1O00291 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HIP1O00291 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HIP1O00291 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HIP1O00291 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HIP1O00291 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HIP1O00291 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HIP1O00291 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HIP1O00291 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HIP1O00291 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HIP1O00291 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HIP1O00291 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HIP1O00291 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HIP1O00291 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HIP1O00291 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
HIP1O00291 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HIP1O00291 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HIP1O00291 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HIP1O00291 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HIP1O00291 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HIP1O00291 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HIP1O00291 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HIP1O00291 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HIP1O00291 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HIP1O00291 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HIP1O00291 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HIP1O00291 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HIP1O00291 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HIP1O00291 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
HIP1O00291 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HIP1O00291 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HIP1O00291 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HIP1O00291 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HIP1O00291 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HIP1O00291 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HIP1O00291 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
HIP1O00291 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HIP1O00291 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HIP1O00291 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms