Protein–RNA interactions for Protein: O00268

TAF4, Transcription initiation factor TFIID subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4O00268 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF4O00268 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF4O00268 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF4O00268 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF4O00268 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF4O00268 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF4O00268 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF4O00268 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF4O00268 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF4O00268 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF4O00268 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF4O00268 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF4O00268 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF4O00268 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF4O00268 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF4O00268 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF4O00268 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF4O00268 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF4O00268 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF4O00268 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF4O00268 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF4O00268 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF4O00268 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF4O00268 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF4O00268 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF4O00268 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF4O00268 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF4O00268 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF4O00268 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF4O00268 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF4O00268 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF4O00268 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF4O00268 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF4O00268 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF4O00268 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF4O00268 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF4O00268 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF4O00268 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF4O00268 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF4O00268 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF4O00268 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF4O00268 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF4O00268 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF4O00268 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TAF4O00268 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TAF4O00268 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF4O00268 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF4O00268 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF4O00268 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF4O00268 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF4O00268 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF4O00268 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF4O00268 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF4O00268 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF4O00268 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF4O00268 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF4O00268 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF4O00268 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF4O00268 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF4O00268 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF4O00268 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF4O00268 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF4O00268 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF4O00268 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF4O00268 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF4O00268 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF4O00268 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF4O00268 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF4O00268 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF4O00268 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF4O00268 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF4O00268 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF4O00268 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF4O00268 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF4O00268 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF4O00268 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF4O00268 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF4O00268 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF4O00268 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF4O00268 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF4O00268 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF4O00268 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF4O00268 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF4O00268 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF4O00268 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF4O00268 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF4O00268 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF4O00268 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF4O00268 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF4O00268 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF4O00268 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF4O00268 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF4O00268 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TAF4O00268 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TAF4O00268 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF4O00268 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF4O00268 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF4O00268 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF4O00268 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF4O00268 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms