Protein–RNA interactions for Protein: K7ERE1

TMEM256-PLSCR3, TMEM256-PLSCR3 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms