Protein–RNA interactions for Protein: D6RBM5

USP17L23, Putative ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 23, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L23D6RBM5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP17L23D6RBM5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP17L23D6RBM5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP17L23D6RBM5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP17L23D6RBM5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP17L23D6RBM5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP17L23D6RBM5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP17L23D6RBM5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP17L23D6RBM5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP17L23D6RBM5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP17L23D6RBM5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP17L23D6RBM5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
USP17L23D6RBM5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP17L23D6RBM5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP17L23D6RBM5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP17L23D6RBM5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP17L23D6RBM5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP17L23D6RBM5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
USP17L23D6RBM5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP17L23D6RBM5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP17L23D6RBM5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
USP17L23D6RBM5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP17L23D6RBM5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP17L23D6RBM5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP17L23D6RBM5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP17L23D6RBM5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP17L23D6RBM5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP17L23D6RBM5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP17L23D6RBM5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP17L23D6RBM5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP17L23D6RBM5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP17L23D6RBM5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP17L23D6RBM5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP17L23D6RBM5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP17L23D6RBM5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP17L23D6RBM5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP17L23D6RBM5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP17L23D6RBM5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
USP17L23D6RBM5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP17L23D6RBM5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP17L23D6RBM5 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP17L23D6RBM5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP17L23D6RBM5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP17L23D6RBM5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP17L23D6RBM5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP17L23D6RBM5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP17L23D6RBM5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP17L23D6RBM5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP17L23D6RBM5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP17L23D6RBM5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP17L23D6RBM5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP17L23D6RBM5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP17L23D6RBM5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP17L23D6RBM5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP17L23D6RBM5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP17L23D6RBM5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP17L23D6RBM5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP17L23D6RBM5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP17L23D6RBM5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP17L23D6RBM5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP17L23D6RBM5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP17L23D6RBM5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP17L23D6RBM5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP17L23D6RBM5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP17L23D6RBM5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
USP17L23D6RBM5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP17L23D6RBM5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP17L23D6RBM5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP17L23D6RBM5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP17L23D6RBM5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
USP17L23D6RBM5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP17L23D6RBM5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP17L23D6RBM5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP17L23D6RBM5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP17L23D6RBM5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP17L23D6RBM5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP17L23D6RBM5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
USP17L23D6RBM5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP17L23D6RBM5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP17L23D6RBM5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP17L23D6RBM5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP17L23D6RBM5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP17L23D6RBM5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP17L23D6RBM5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
USP17L23D6RBM5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP17L23D6RBM5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP17L23D6RBM5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP17L23D6RBM5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP17L23D6RBM5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP17L23D6RBM5 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP17L23D6RBM5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP17L23D6RBM5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP17L23D6RBM5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
USP17L23D6RBM5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
USP17L23D6RBM5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP17L23D6RBM5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP17L23D6RBM5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP17L23D6RBM5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
USP17L23D6RBM5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP17L23D6RBM5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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