Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
B4DXG7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
B4DXG7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
B4DXG7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
B4DXG7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
B4DXG7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
B4DXG7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
B4DXG7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
B4DXG7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
B4DXG7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
B4DXG7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
B4DXG7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
B4DXG7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
B4DXG7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
B4DXG7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
B4DXG7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
B4DXG7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
B4DXG7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
B4DXG7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
B4DXG7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
B4DXG7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
B4DXG7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
B4DXG7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
B4DXG7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
B4DXG7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
B4DXG7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
B4DXG7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
B4DXG7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
B4DXG7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
B4DXG7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
B4DXG7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
B4DXG7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
B4DXG7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
B4DXG7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.32■■□□□ 1
B4DXG7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
B4DXG7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
B4DXG7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
B4DXG7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
B4DXG7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
B4DXG7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
B4DXG7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
B4DXG7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
B4DXG7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
B4DXG7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
B4DXG7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.31■■□□□ 1
B4DXG7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
B4DXG7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
B4DXG7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
B4DXG7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
B4DXG7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
B4DXG7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
B4DXG7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
B4DXG7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
B4DXG7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
B4DXG7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
B4DXG7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
B4DXG7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
B4DXG7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.3■■□□□ 1
B4DXG7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.3■■□□□ 1
B4DXG7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.3■■□□□ 1
B4DXG7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
B4DXG7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
B4DXG7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
B4DXG7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
B4DXG7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
B4DXG7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
B4DXG7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.29■■□□□ 1
B4DXG7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
B4DXG7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
B4DXG7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.28■■□□□ 1
B4DXG7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
B4DXG7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
B4DXG7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
B4DXG7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
B4DXG7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
B4DXG7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.28■■□□□ 1
B4DXG7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
B4DXG7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
B4DXG7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.27■■□□□ 1
B4DXG7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
B4DXG7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
B4DXG7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
B4DXG7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
B4DXG7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
B4DXG7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
B4DXG7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
B4DXG7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
B4DXG7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
B4DXG7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
B4DXG7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
B4DXG7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
B4DXG7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
B4DXG7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
B4DXG7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
B4DXG7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
B4DXG7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
B4DXG7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
B4DXG7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
B4DXG7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
B4DXG7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms