Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMIM1B2RUZ4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms