Protein–RNA interactions for Protein: A6NI56

CCDC154, Coiled-coil domain-containing protein 154, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC154A6NI56 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC154A6NI56 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC154A6NI56 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC154A6NI56 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC154A6NI56 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC154A6NI56 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC154A6NI56 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC154A6NI56 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC154A6NI56 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC154A6NI56 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC154A6NI56 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC154A6NI56 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC154A6NI56 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC154A6NI56 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC154A6NI56 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC154A6NI56 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC154A6NI56 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC154A6NI56 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC154A6NI56 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC154A6NI56 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC154A6NI56 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC154A6NI56 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC154A6NI56 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC154A6NI56 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC154A6NI56 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC154A6NI56 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC154A6NI56 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC154A6NI56 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC154A6NI56 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC154A6NI56 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC154A6NI56 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC154A6NI56 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC154A6NI56 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC154A6NI56 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC154A6NI56 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC154A6NI56 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC154A6NI56 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC154A6NI56 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC154A6NI56 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC154A6NI56 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC154A6NI56 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC154A6NI56 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC154A6NI56 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC154A6NI56 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC154A6NI56 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC154A6NI56 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC154A6NI56 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC154A6NI56 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC154A6NI56 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC154A6NI56 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC154A6NI56 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC154A6NI56 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC154A6NI56 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC154A6NI56 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC154A6NI56 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC154A6NI56 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC154A6NI56 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC154A6NI56 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC154A6NI56 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC154A6NI56 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC154A6NI56 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC154A6NI56 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC154A6NI56 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC154A6NI56 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC154A6NI56 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC154A6NI56 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC154A6NI56 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC154A6NI56 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC154A6NI56 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC154A6NI56 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC154A6NI56 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC154A6NI56 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC154A6NI56 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC154A6NI56 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC154A6NI56 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC154A6NI56 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC154A6NI56 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC154A6NI56 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC154A6NI56 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC154A6NI56 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC154A6NI56 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC154A6NI56 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC154A6NI56 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC154A6NI56 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC154A6NI56 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC154A6NI56 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC154A6NI56 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC154A6NI56 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC154A6NI56 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC154A6NI56 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC154A6NI56 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC154A6NI56 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC154A6NI56 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC154A6NI56 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC154A6NI56 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC154A6NI56 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC154A6NI56 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC154A6NI56 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC154A6NI56 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC154A6NI56 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms