Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYCE3A1L190 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYCE3A1L190 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SYCE3A1L190 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYCE3A1L190 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYCE3A1L190 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYCE3A1L190 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYCE3A1L190 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYCE3A1L190 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYCE3A1L190 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYCE3A1L190 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYCE3A1L190 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYCE3A1L190 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYCE3A1L190 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYCE3A1L190 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYCE3A1L190 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYCE3A1L190 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYCE3A1L190 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYCE3A1L190 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYCE3A1L190 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYCE3A1L190 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYCE3A1L190 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYCE3A1L190 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYCE3A1L190 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYCE3A1L190 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYCE3A1L190 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYCE3A1L190 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYCE3A1L190 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYCE3A1L190 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYCE3A1L190 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SYCE3A1L190 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYCE3A1L190 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYCE3A1L190 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYCE3A1L190 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYCE3A1L190 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYCE3A1L190 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SYCE3A1L190 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYCE3A1L190 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYCE3A1L190 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYCE3A1L190 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYCE3A1L190 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYCE3A1L190 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYCE3A1L190 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYCE3A1L190 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SYCE3A1L190 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYCE3A1L190 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYCE3A1L190 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYCE3A1L190 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYCE3A1L190 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYCE3A1L190 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYCE3A1L190 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYCE3A1L190 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYCE3A1L190 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYCE3A1L190 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYCE3A1L190 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYCE3A1L190 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYCE3A1L190 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYCE3A1L190 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYCE3A1L190 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYCE3A1L190 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYCE3A1L190 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYCE3A1L190 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYCE3A1L190 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYCE3A1L190 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYCE3A1L190 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYCE3A1L190 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYCE3A1L190 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYCE3A1L190 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYCE3A1L190 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYCE3A1L190 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYCE3A1L190 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYCE3A1L190 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYCE3A1L190 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYCE3A1L190 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SYCE3A1L190 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYCE3A1L190 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYCE3A1L190 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYCE3A1L190 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYCE3A1L190 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYCE3A1L190 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYCE3A1L190 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYCE3A1L190 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYCE3A1L190 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYCE3A1L190 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SYCE3A1L190 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYCE3A1L190 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYCE3A1L190 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYCE3A1L190 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYCE3A1L190 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYCE3A1L190 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYCE3A1L190 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYCE3A1L190 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYCE3A1L190 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SYCE3A1L190 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYCE3A1L190 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYCE3A1L190 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SYCE3A1L190 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYCE3A1L190 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SYCE3A1L190 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYCE3A1L190 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms