Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIMS3Q9UJD0 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms