Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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