Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV90

SNRNP25, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 25 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP25Q9BV90 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRNP25Q9BV90 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms