Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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