Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 HOXB13-201ENST00000290295 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 REXO5-208ENST00000564274 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 SH2D5-201ENST00000375031 3705 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 ARPP21-213ENST00000428373 3150 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 GRM1-202ENST00000355289 3874 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 CYTH1-203ENST00000585509 3315 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 PNPLA8-208ENST00000453144 3366 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 PLEKHA2-207ENST00000616834 3594 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 GRM2-202ENST00000395052 3151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 DNAJC11-202ENST00000377577 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 C22orf39-202ENST00000399562 3350 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 MAP1S-202ENST00000544059 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 TBX3-201ENST00000257566 4208 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 FAM214B-208ENST00000605244 3016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 AAGAB-207ENST00000561452 2251 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 SLC38A7-215ENST00000570101 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 DRC7-203ENST00000394337 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms