Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 HLCS-207ENST00000612277 6112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 SLC46A1-207ENST00000612814 6376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 TRPC6-201ENST00000344327 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 LINC02188-202ENST00000569740 3775 ntTSL 4 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 AL358334.2-201ENST00000553648 4714 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms