Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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C9orf85Q96MD7 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C9orf85Q96MD7 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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