Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TM4SF18Q96CE8 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms