Protein–RNA interactions for Protein: Q96C92

SDCCAG3, Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SDCCAG3Q96C92 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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SDCCAG3Q96C92 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SDCCAG3Q96C92 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SDCCAG3Q96C92 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SDCCAG3Q96C92 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SDCCAG3Q96C92 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SDCCAG3Q96C92 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SDCCAG3Q96C92 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SDCCAG3Q96C92 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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