Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD06

AGR3, Anterior gradient protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGR3Q8TD06 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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AGR3Q8TD06 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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AGR3Q8TD06 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AGR3Q8TD06 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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