Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBN0

RAB3IL1, Guanine nucleotide exchange factor for Rab-3A, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IL1Q8TBN0 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IL1Q8TBN0 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 2473.3 ms